邓世昌纪念馆落址于广州市海珠区邓氏宗祠内。轩昂气派的岭南祠堂建筑，占地4700平方米，碧墙灰瓦，掩映在寻常巷陌的榕荫中。庭院呈船台状，三路两进三院的格局风情典雅，通敞透亮，移步换景。有石额楹联、通花木雕点缀，更兼重门纳画、木石风神，端庄肃穆，古朴洗练。花园存有邓世昌手植苹婆树一株，枯木逢春的灵芝两枚，古树婆娑数棵。“云台功首、甲午名留”，睹物思人，英雄精神养育着中华民族无数风流人物之人格襟怀，激浊扬清，重塑民族大义。

邓氏宗祠始建于1834年，邓世昌于光绪二十年（1894）中日甲午海战中壮烈殉国后，清廷追封其为“从一品”官，故宗祠正门按一品官员规格，建6级台阶，以清代中晚期南方大祠堂的形式重建。整座建筑以长条花岗石为基础，高出地面1米后再用水磨青砖砌墙，以进口坤甸木为柱和梁架，屋顶是灰塑瓦脊、碌筒瓦面。主体建有前后座，用两廊相连，并在四角各建1座阁楼。另有东院和后花园、东西门楼、前院和照壁等。正门门额上书“邓氏宗祠”字样，两侧挂有“云台功首”、“甲午名留”的楹联。后花园有一棵紫荆树和一棵凤眼果树，据传邓世昌当年赴威海前所植。花园外东面原有车马场、清光绪、宣统年间，幕名前来瞻仰均在此下车，再步行前往祠堂拜。